Corso di Laurea Specialistica in Informatica
Corso di Laurea Specialistica in Tecnologie Informatiche
anno accademico 2007-2008

BIOINFORMATICA






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Avvisi

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  • [14/12/2007] Sono usciti i voti. La verbalizzazione avverrà Lunedì 17 Dicembre dalle ore 16 nella stanza del docente.
  • [27/11/2007] A causa di un impegno (corso obbligatorio di sicurezza sul lavoro), il ricevimento di Mercoledì 28 Novembre non avrà luogo. Per essere ricevuti questa settimana contattare il docente per mail.
  • [14 Novembre 2007] The students Chuan Guo and Jiayi Shi should please contact the teacher.
  • [13 Novembre 2007] Nuove modifiche alle date di seminari: Ricerca di blocchi di sintenia di Santoro e Raglianti anticipato al 27 Novembre e Il tool FANMOD di E.Croci posticipato al 13 Dicembre.
  • [9 Novembre 2007] Modificata la data di un seminario (quello del 27 Novembre è anticipato al 13).
  • [8 Novembre 2007] Pubblicate date e modalità dei seminari.
  • [24 Ottobre 2007] Il ricevimento del 31 Ottobre non avrà luogo. Per concordare altri orari in quella settimana (Lunedì 29 o Martedì 30), contattare il docente per mail o a lezione.
  • [16 Ottobre 2007] Cambio orario di ricevimento.
  • [8 Ottobre 2007] Assegnati argomenti per seminari (e aggiornato il sito di conseguenza).
  • [29 Settembre 2007] Sono sul sito gli argomenti per i seminari.
  • [28 Settembre 2007] Il ricevimento di Martedì 2 Ottobre è rimandato a Giovedì 4 Ottobre (stesso orario) a causa di altri impegni didattici.
  • [26 Settembre 2007] Il materiale è disponibile presso la copisteria Il Torchio in via Fucini.



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    Descrizione del Corso

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    Il corso vale 6 CFU (circa 48 ore).
    La frequenza è obbligatoria (salvo che per gli studenti-lavoratori).

    Obiettivi

    L'obiettivo del corso è di fornire allo studente una panoramica di algoritmi non banali concepiti per lo studio di sequenze genomiche. Verra' prestata attenzione sia agli aspetti teorici e combinatori che a quelli pratici posti dai vari problemi quali il sequenziamento di interi genomi, l'allineamento di sequenze, la ricerca di pattern ripetiti e di lunghe ripetizioni approssimate, il calcolo di distange genomiche, e altri problemi biologicamente rilevanti per lo studio di sequenze molecolari.

    Programma

    Orario delle lezioni

    Lunedì dalle ore 16 alle ore 18 in aula C1.

    Martedì dalle ore 16 alle ore 18 in aula E.

    Ricevimento

    Mercoledì 11-13 presso la stanza del docente, Dipartimento di Informatica.

    Riferimenti

    I riferimenti verranno indicati lezione per lezione in questa pagina e verranno resi disponibili agli studenti.
    Saranno comunque parte dei seguenti testi:



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    Modalità d'esame

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    Seminari a gruppi di 2-3 persone da svolgersi prioritariamente entro Natale (2007!).
    Questi saranno rivolti a tutti gli studenti di questo corso e del corso omonimo della laurea Specialistica in Scienze e Tecnologie Biomolecolari.

    I tempi assegnati per i seminari sono di mezzora a persona; pertanto, i gruppi di tre persone hanno assegnati 90 minuti, quelli di due persone 60 minuti, e quelli di una sola persona 30 minuti.

    Chiunque avesse bisogno di un computer per proiettare slides al seminario è pregato di contattare il docente con ragionevole anticipo.

    Argomenti per i seminari:

    Su eventuale richiesta dello studente l'esame può essere svolto con altre modalità (scritto, orale, seminario non in gruppo, eccetera).

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    Sommario delle lezioni

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